薄膜蒸發器需要充入大量制冷劑，液柱對蒸發溫度將會有一定的影響。且當鹽水濃度降低或鹽水泵因故停機時，鹽水在管內有被凍結的可能。若制冷劑為氟利昂，則氟利昂內溶解的潤滑油很難返回壓縮機。

薄膜蒸發器由于采用壓縮機提供熱源，和傳統蒸發器相比，溫差小得多，能夠達到溫和蒸發，很大地提高產品質量、降低結垢。無需冷凝器或只需很小面積的冷凝器，結構與流程非常簡單，全自動操作，可連續運行，an全可靠。